直前期にそういうことするから

EclipseMEからEclipse本家に統合されたMTJに移行→publicでないクラスに対応してない＋$を内部クラスとして処理
例：Test.javaからはTest.classとTest$*.classができると勝手に解釈
になってたせいでCUPの吐くpackage privateでしかもクラス名に$が入ってる気持ち悪いクラスのクラスファイルをJARに入れてくれず、NoClassDefFoundErrorという悲劇。これはひどい。オレはpackage privateなクラスも名前に$の入ったクラスも書いてないぞ・・・！
EclipseMEに戻すことも考えたけどparser.javaを解析(笑)してpackage privateなクラスをpublic classにして別ファイルにしちゃうコードをでっちあげました。これはひどい。$を_に直すため、ソースコードに特に意味のある$がないことを確認したのち、フル置換。これはひどい。
あとはAntでパーザジェネレートの後にこれをjava実行してやるだけです。二重にかけると壊れるので防止機能付き＾＾。

package tools;

import java.io.File;
import java.io.FileWriter;
import java.io.IOException;
import java.util.Scanner;

public class ParserFix {

	/**
	 * @param args dir
	 * @throws IOException
	 */
	public static void main(String[] args) throws IOException {
		if(args.length != 1){
			System.err.println("Usage: ParserFix dir");
			System.exit(1);
		}
		System.out.println("Parser Fix...");

		String dir = args[0];
		Scanner scanner = new Scanner(new File(dir + "/parser.java"));

		StringBuilder s1 = new StringBuilder();
		StringBuilder s2 = new StringBuilder();
		StringBuilder s3 = new StringBuilder();

		int mode = 1;
		while(scanner.hasNextLine()){
			String line = scanner.nextLine();
			line = line.replace("class CUP$parser$actions", "public class CUP$parser$actions");
			line = line.replace('$', '_');
			if(mode == 1){
				if(line.startsWith("/** CUP")){
					mode = 2;
				}
				else{
					s1.append(line);
					s1.append('\n');
				}
			}
			if(mode == 2){
				if(line.startsWith("/** Cup generated class to encapsulate user supplied action code.*/")){
					mode = 3;
				}
				else{
					s2.append(line);
					s2.append('\n');
				}
			}
			if(mode == 3){
				s3.append(line);
				s3.append('\n');
			}
		}
		scanner.close();

		if(s3.length() == 0){
			System.out.println("Already fixed.");
			System.exit(0);
		}

		FileWriter out;
		out = new FileWriter(dir + "/parser.java");
		out.write(s1.toString());
		out.write(s2.toString());
		out.close();
		out = new FileWriter(dir + "/CUP_parser_actions.java");
		out.write(s1.toString());
		out.write(s3.toString());
		out.close();
		System.out.println("Fixed successfully.");
	}

}